Modelación Salud Pública Chile 2025
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Horarios y sesiones

Día Sesión Bloque Contenidos principales Material / Lecturas
Día 1 09:00–10:30 Teoría
  • Introducción a análisis de decisión
  • Buenas prácticas (ISPOR-SMDM, transparencia, validación y verificación)
  • Elementos de un marco de decisión
Presentación (Día 1) Material / Lecturas (Día 1)
Día 1 10:30–10:45 Pausa café Pausa para café y descanso.
Día 1 10:45–12:30 Teoría
  • Estructuración de decisiones
  • Motivación del uso de modelos de decisión en salud
  • Propósitos, tipos (árboles de decisión, cSTM, microsimulación, DES), cuándo usar cada uno
  • Introducción a análisis de costo-efectividad y evaluación económica
  • Costos directos, utilidades, horizonte temporal, tasa de descuento (p. ej., 3% anual)
  • Razón de costo-efectividad incremental (RCEI), limitaciones del RCEI, enfoque de beneficio monetario neto (NMB) o de salud (NHB)
  • Plano costo-efectividad e interpretación
  • Resúmenes para decisión: tablas de dominancia/extendida, estrategia óptima por umbral
Día 1 14:00–15:15 Teoría
  • Shopping spree
  • Costo-efectividad incremental
Día 1 15:15–15:30 Pausa café Pausa para café y descanso.
Día 1 15:30–16:30 Laboratorio en
  • Preparación del proyecto (estructura de carpetas, GitHub, control de versiones opcional, uso de dampack y darthtools)
  • Costo-efectividad incremental en R
Día 2 09:00–10:30 Teoría
  • Modelos Markov (aka cSTMs: cohort state-transition models) independientes del tiempo
  • Definición de estados de salud, horizonte temporal, tamaño de ciclo y corrección de medio ciclo
  • Probabilidades y tasas de transición constantes
  • Parametrización: probabilidades vs tasas y transformaciones
  • Estructura matricial (matrices de transición) y traza de la cohorte
  • Desenlaces de interés: QALYs, años de vida, costos
  • Desenlaces con descuento
Presentación (Día 2) Material / Lecturas (Día 2)
Día 2 10:30–10:45 Pausa café Pausa para café y descanso.
Día 2 10:45–12:30 Laboratorio en
  • Implementación paso a paso de un modelo Markov de tres estados independiente del tiempo:
    • Definición de estados (Healthy, Sick, Dead)
    • Construcción de matrices de transición independientes del tiempo
    • Simulación de la cohorte y cálculo de resultados
    • Aplicación de corrección de medio ciclo y descuento
  • Diagnósticos y cálculo y visualización de desenlaces del modelo de tres estados:
    • Verificación de sumas de probabilidades
    • Generación de desenlaces: traza de la cohorte, curva de sobrevida, esperanza de vida, prevalencia, y costos
    • Gráfico de desenlaces
  • Actividad en grupo – Implementación del modelo Sick-Sicker independiente del tiempo:
    • Definición de estados (Healthy, Sick, Sicker, Dead)
    • Construcción de matrices de transición independientes del tiempo
    • Simulación de la cohorte y cálculo de resultados
    • Aplicación de corrección de medio ciclo y descuento
    • Verificación de sumas de probabilidades
    • Generación de desenlaces: traza de la cohorte, curva de sobrevida, esperanza de vida, prevalencia, y costos
    • Gráfico de desenlaces
Día 2 14:00–15:00 Teoría
  • Modelos Markov dependientes del tiempo de simulación (p.ej., dependientes de la edad):
  • Transiciones dependientes de la edad: mortalidad general (tablas de vida), riesgos de enfermedad específica de la edad, etc.
  • Estructura matricial (matrices de transición por edad)
  • Modelos Markov dependientes del tiempo de residencia en un estado:
  • Transiciones dependientes del tiempo en un estado: severidad o mortalidad incrementa conforme se pasa el tiempo estando enfermo
  • Creación de túneles en la estructura matricial
Día 2 15:00–15:15 Pausa café Pausa para café y descanso.
Día 2 15:15–16:30 Laboratorio en
  • Implementación paso a paso de un modelo Markov de 3 estados dependiente de la edad:
    • Definición de estados (Healthy, Sick, Dead)
    • Importación de tablas de vida y vinculación al modelo
    • Construcción de matrices de transición dependientes de la edad
    • Simulación de la cohorte y cálculo de desenlaces
    • Aplicación de corrección de medio ciclo y descuento
  • Diagnósticos y cálculo y visualización de desenlaces del modelo de tres estados:
    • Verificación de sumas de probabilidades
    • Generación de desenlaces: traza de la cohorte, curva de sobrevida, esperanza de vida, prevalencia, y costos
    • Gráfico de desenlaces
  • Actividad en grupo – Implementación del modelo Sick-Sicker dependiente de la edad:
    • Definición de estados (Healthy, Sick, Sicker, Dead)
    • Construcción de matrices de transición dependientes de la edad
    • Simulación de la cohorte y cálculo de resultados
    • Aplicación de corrección de medio ciclo y descuento
    • Verificación de sumas de probabilidades
    • Generación de desenlaces: traza de la cohorte, curva de sobrevida, esperanza de vida, prevalencia, y costos
    • Gráfico de desenlaces
  • Implementación paso a paso de un modelo Markov de 3 estados dependiente del tiempo en un estado:
    • Definición de estados (Healthy, Sick, Dead), expandiendo el estado Sick con túneles
    • Construcción de matrices de transición con túneles
    • Simulación de la cohorte y cálculo de desenlaces
    • Aplicación de corrección de medio ciclo y descuento
  • Diagnósticos y cálculo y visualización de desenlaces del modelo de tres estados:
    • Verificación de sumas de probabilidades
    • Generación de desenlaces: traza de la cohorte, curva de sobrevida, esperanza de vida, prevalencia, y costos
    • Gráfico de desenlaces
  • Actividad en grupo (si da tiempo) – Implementación del modelo Sick-Sicker con transiciones dependientes del tiempo que se está en el estado Sick
Día 3 09:00–10:30 Teoría
  • Conceptos de calibración:
  • ¿Por qué calibrar? Objetivos de calibración, selección de targets
  • Funciones objetivo: verosimilitud, mínimos cuadrados
  • Identificabilidad
  • Algoritmos de búsqueda determinística y estocástica:
  • Nelder-Mead, algoritmos evolutivos, simulated annealing
  • Descripción de modelo de 3 estados de recurrencia de cáncer para ser calibrado en laboratorio
Presentación (Día 3) Material / Lecturas (Día 3)
Día 3 10:30–10:45 Pausa café Pausa para café y descanso.
Día 3 10:45–12:30 Laboratorio en
  • Descripción de parámetros y desenlaces de un modelo Markov de tres estados de recurrencia de cáncer
  • Preparación de targets de calibración (supervivencia) y función de costo/verosimilitud de un modelo Markov de tres estados de recurrencia de cáncer
  • Calibración determinística:
    • Implementación de función objetivo
    • Búsqueda local con Nelder-Mead y global con DEoptim y simulated annealing
  • Actividad en grupo – Calibración del modelo Sick-Sicker:
    • Descripción de parámetros y desenlaces
    • Preparación de targets de calibración (supervivencia, prevalencia de Sick+Sicker y proporción de Sick de Sick+Sicker) y función de costo/verosimilitud
    • Implementación de función objetivo
    • Búsqueda local con Nelder-Mead y global con DEoptim y simulated annealing
Día 3 14:00–15:00 Teoría
  • Calibración Bayesiana:
  • Distribuciones previa y posterior
  • Algoritmos para muestrear de la distribución posterior
  • MCMC (Metropolis-Hastings), diagnóstico
  • Sampling-Importance Resampling (SIR)
  • Incremental Mixture Importance Sampling (IMIS)
  • Tamaño de muestra efectivo
  • Selección de targets
  • Validación interna, y evaluación de ajuste/robustez
Día 3 15:00–15:15 Pausa café Pausa para café y descanso.
Día 3 15:15–16:30 Laboratorio en
  • Calibración Bayesiana de modelo de tres estados con IMIS:
    • Definición de priors, likelihood y corrida IMIS
    • Diagnóstico de convergencia y posterior summaries
    • Graficación de parámetros calibrados
  • Actividad en grupo – Calibración Bayesiana del modelo Sick-Sicker con IMIS:
    • Definición de priors, likelihood y corrida IMIS
    • Diagnóstico de convergencia y posterior summaries
    • Graficación de parámetros calibrados, reproducibilidad (semillas, perfiles de sesión)
Día 4 09:00–10:30 Teoría
  • Análisis de sensibilidad:
  • Motivación
  • Análisis de sensibilidad de un parámetro
  • Análisis de umbral
  • Análisis de sensibilidad de dos parámetros
Presentación (Día 4) Material / Lecturas (Día 4)
Día 4 10:30–10:45 Pausa café Pausa para café y descanso.
Día 4 10:45–12:30 Laboratorio en
  • Análisis de sensibilidad con dampack:
    • Análisis de sensibilidad de una vía
    • Análisis de umbral
    • Análisis de sensibilidad de dos vías
Día 4 14:00–15:15 Teoría
  • Análisis probabilístico
  • Motivación
  • Toma de decisión bajo incertidumbre
  • Parámetros y correlaciones; elección de distribuciones (beta, gamma, lognormal, Dirichlet, etc.)
  • Curvas y reglas de decisión:
  • CEAC (probabilidad de ser más costo-efectivo), CEAF (estrategia óptima promedio)
  • Curvas de pérdida esperada
  • Presentación para tomadores de decisión (umbrales de disposición a pagar; análisis de escenarios)
  • (Opcional si da tiempo) Análisis de valor de la información (EVPI/EVPPI) y prioridades de investigación
Día 4 15:00–15:15 Pausa café Pausa para café y descanso.
Día 4 15:15–16:30 Laboratorio en
  • Implementación de PA:
    • Muestreo LHS, correlaciones
  • Cálculo de ICER, NMB y generación de:
    • Plano CE con densidades
    • CEAC y CEAF (dampack)
    • Curvas de pérdida esperada (dampack)
    • Paralelización básica (parallel) y control de semillas
Día 5 09:00–10:30 Teoría
  • Motivación de simulación de eventos discretos (DES)
  • Cuándo elegir DES vs cSTM
  • Procesos puntuales de Poisson homogéneos y no-homogéneos
  • Muestreo de tiempos de evento
  • Descuento continuo
Presentación (Día 5) Material / Lecturas (Día 5)
Día 5 10:30–10:45 Pausa café Pausa para café y descanso.
Día 5 10:45–12:30 Laboratorio en
  • Implementación de un modelo de DES en R
  • Uso de data.table para implementar un DES
  • Cálculo de siguientes eventos
  • Métricas de desenlace (tiempos de espera, esperanza de vida, tiempo en estado)
  • Cálculo de desenlaces económicos
  • Descuento intertemporal
Día 5 14:00–15:15 Teoría
  • Qué es un emulador
  • Cuándo un emulador es útil (PA costoso, calibración multiobjetivo)
  • Emulador con regresión lineal y sus aplicaciones para análisis de sensibilidad
  • Análisis de sensibilidad de uno y dos parámetros
  • Análisis de umbral
Día 5 15:15–15:30 Pausa café Pausa para café y descanso.
Día 5 15:30–16:30 Teoría
  • Emuladores y calibración acelerada:
  • Diseño de experimentos (LHS)
  • Emuladores con redes neuronales artificiales (ANNs), validación predictiva
  • Ajuste de ANN y validación
  • Calibración Bayesiana con emuladores
  • rstan; comparación con evaluación directa
Jorge Roa | Feral lab | Stanford ©